Mahahual alberga una gran diversidad de especies marinas y terrestres que forman parte de los ecosistemas característicos de la costa caribeña. Debido a ello, uno de los aspectos que ha llamado la atención en relación con el proyecto es la posible interacción entre las nuevas instalaciones y la biodiversidad presente en la zona. Entre las especies que podrían verse involucradas se encuentran peces de arrecife, corales, tortugas marinas, aves costeras y diversos organismos que dependen del equilibrio natural del entorno.

La construcción y operación de una infraestructura de estas características puede generar cambios en el uso del espacio, en los niveles de actividad humana y en algunos procesos naturales del área. Por esta razón, suelen realizarse estudios y evaluaciones que permitan identificar los posibles efectos sobre los ecosistemas y determinar las medidas que podrían aplicarse para reducir impactos no deseados.

El tema de la biodiversidad constituye un elemento importante dentro del análisis del proyecto, ya que los arrecifes y ecosistemas costeros de Mahahual desempeñan un papel fundamental en la conservación de especies y en el funcionamiento ambiental de la región. Por ello, la relación entre el desarrollo de nuevas obras y la protección de estos recursos naturales continúa siendo un aspecto de interés para distintos sectores de la comunidad.